MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	GGCAGA	2	12	7113	7124	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017510	GAG	2	6	7141	7146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017510	CG	3	6	7167	7172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017510	TGC	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017510	ACCCC	2	10	11717	11726	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_017510	CGGC	2	8	11755	11762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017510	CCCGC	2	10	11817	11826	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8	NC_017510	TCA	2	6	11924	11929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017510	GGC	2	6	13593	13598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017510	GCC	2	6	13603	13608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017510	TCAG	2	8	13662	13669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017510	TTA	2	6	13705	13710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017510	AATT	2	8	14246	14253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017510	TAT	2	6	14254	14259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017510	AATA	2	8	14264	14271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017510	ATTT	2	8	14299	14306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017510	AG	3	6	14346	14351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017510	TGG	2	6	14394	14399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017510	GTT	2	6	14507	14512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017510	ATTT	2	8	14513	14520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017510	TTA	2	6	14530	14535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017510	TGA	2	6	14587	14592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017510	TAT	2	6	14606	14611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017510	TAG	2	6	18630	18635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017510	GGAA	2	8	18665	18672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017510	AGGGC	2	10	18679	18688	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017510	CCT	2	6	19020	19025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017510	AATTG	2	10	19030	19039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017510	CCAT	2	8	19057	19064	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017510	TTA	2	6	22102	22107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017510	GTT	2	6	29644	29649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017510	A	6	6	29650	29655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017510	TCGT	2	8	29656	29663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017510	AT	3	6	30748	30753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017510	A	9	9	30793	30801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017510	AATG	2	8	30836	30843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017510	AGG	2	6	31262	31267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017510	A	6	6	32601	32606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017510	A	6	6	32721	32726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017510	A	6	6	32747	32752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017510	GCC	2	6	32928	32933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017510	A	7	7	32962	32968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017510	T	8	8	32973	32980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017510	CGGA	2	8	33568	33575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017510	TAT	2	6	35528	35533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017510	C	8	8	35538	35545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017510	CTG	2	6	35570	35575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017510	CAG	2	6	35599	35604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017510	ATTAA	2	10	35619	35628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017510	A	6	6	36681	36686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017510	T	6	6	36702	36707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017510	T	6	6	38364	38369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017510	AAT	2	6	38414	38419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017510	T	6	6	38436	38441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017510	TCA	2	6	38472	38477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017510	AT	3	6	38489	38494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017510	ATT	2	6	38498	38503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017510	ATGTAC	2	12	38555	38566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017510	TGT	2	6	38638	38643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.